自動化立體倉庫的同樣存在缺點：
　　1、由于自動化立體倉庫的結(jié)構(gòu)比較復雜，配套設(shè)備也比較多，所以需要的基建和設(shè)備的投資也比較大。
　　2、貨架安裝精度要求高，施工比較困難，而且工期相應(yīng)較長。
　　3、存儲彈性小，難以應(yīng)付高峰的需求。難以應(yīng)付包裝多類型的倉儲需求。
　　4、對可存儲的貨物品種有一定限制，需要單獨設(shè)立存儲系統(tǒng)用于存放長、大、笨重的貨物以及要求特殊保管條件的貨物。
　　5、自動化立體倉庫的高架吊車、自動控制系統(tǒng)等都是技術(shù)含量極高的設(shè)備，維護要求高，因此必須依賴供應(yīng)商，以便在系統(tǒng)出現(xiàn)故障時能得到及時的技術(shù)援助。這就增強了對供應(yīng)商的依賴性。
　　6、對建庫前的工藝設(shè)計要求高，在投產(chǎn)使用時要嚴格按照工藝作業(yè)。
　　7、過度依賴自動化也會有很大的風險，比如當意外停電，夏季限電，或者系統(tǒng)意外當機的時候怎么辦?

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